Génésis est un monde enchaîné depuis des siècles par une terrible malédiction : toutes les nuits, sans que l’ont sache d’où, des taches noires apparaissent au sol desquelles émergent des monstres terrifiants qui massacrent les vivants. Selon la religion, ses êtres sont les âmes des Engeliers, ancien peuple élu par la Déesse Engélion qui s’est retournée contre ses principes qui prônaient l’amour et le partage de la lumière sacrée ; de ce fait, ces monstres s’appellent des Damnés. La seule et unique chose qui puisse repousser ces créatures est l’engélion, la lumière de la Déesse, présente sur terre sous plusieurs formes et utilisée par les grandes villes comme source d’énergie, d’armement et donc de protection. Seules les grandes villes en bénéficient pleinement et sont donc sûres la nuit venue ; les petits villages devant se débrouiller comme ils peuvent avec les rations accordées ou autrement.

Engélion est un astre, une étoile, qui, avant la malédiction, se levait tous les ans pour gorger la terre de sa lumière sacrée ( nommée engélion) ; on appelait ça la Levée. La Levée durait 7 jours et 7 nuits durant lesquels personne ne pouvait mourir. Depuis la malédiction donc, l’Étoile ne se lève plus dans le ciel et ne gorge plus ta planète de son énergie divine. Mais, il y a 22 ans, une Levée inopinée et inexplicable a illuminé le ciel pendant 7 jours et 7 nuits. Quelques heures avant ce miracle, Ariaé, jeune femme enceinte de 8 mois, voit son village Anima attaqué par l’armée. Cette dernière pourchasse depuis des mois et des mois toutes les femmes enceintes d’un périmètre donné et les tue, puis rase le village. Grâce à l’aide d’Avram, le chaman de son village, Ariaé parvient à fuir et accouche dans la forêt avant de mourir. Une seconde après sa mort, la Levée apparaît et garde en vie son nouveau-né, Lilium, notre héroïne.

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Depuis cette Levée incroyable, Engélion ne se lève plus et a confié en quelque sorte son pouvoir et son autorité divine a un homme, le Fenhir. Le Fenhir est le maître du monde, considéré par la population comme quasi divin. Il est immortel grâce à un mystérieux procédé : en effet, il puise l’engélion du corps d’une femme nommée Liorah pour se l’injecter dans les veines et décupler sa puissance et sa longévité. Liorah serait la première Engelière, et le Fenhir nourrit envers elle une amertume étrange teintée de sentiments... ambigus. Les fonctions vitales de Liorah diminuent, et le Fenhir chercher un moyen de la remplacer pour assurer sa puissance et sa survie.

Le Fenhir siège à Hallegarde, la ville la plus sainte qui soit sur Génésis et la plus puissante de toutes. Lilium a grandi et y vit avec Jana, sa mère adoptive, et Kira, sa petite soeur également adoptée et amnésique.
Lilium est devenue une jeune femme qui se conforme à la tyrannie qu’impose le Fenhir. Elle insiste, impuissante et silencieuse, au massacre des quelques rares opposants au tyran, dont son amie Aline. Le soir même de cette attaque, Kira, persuadée que les Damnés ont une sorte d’âme et de conscience, sort en pleine nuit vérifier ses dires. C’est un électrochoc pour Lilium qui court tenter de la secourir. Elle y parvient malgré une attaque des Damnés, et se découvre la capacité de manipuler/ créer la lumière divine de son corps. Cette dernière a explosé d’elle et a détruit instantanément tous les Damnés aux alentours.
Un homme a assisté à cette scène, le colonel Hlodowig. Dans cet évènement, il revoit le courage insensé dont sa défunte femme a fait preuve pour tenter de sauver leur enfant lors d’une attaque de Damnés dans son village il y a + de 20 ans. De ce fait, remué, il ment au Fenhir et minimise les faits pour protéger Lilium. En effet, le Fenhir compte remplacer Liorah, sa source d’énergie, par une personne comme Lilium, un enfant de la prophétie. Lilium ne remplacera donc pas Liorah mais sera envoyée au Sanctuaire, un camp militaire où s’entraînent les enfants au même don qu’elle pour devenir une arme pour le compte du Fenhir.

Dans sa cellule, la veille de son transfert, elle reçoit la visite d’un inconnu nommé Sirius, qui lui recommande chaudement de fuir par tous les moyens l’endroit où la milice du Fenhir compte l’emmener et de rejoindre Vicit.
Durant le trajet vers le Sanctuaire, Lilium rencontre Cael, Éophémia et Eniss, trois personnes capables comme elle de manipuler l’engélion. Durant une attaque de bête sauvage, Lilium explose de nouveau de lumière, ravage tout mais sauve tout le monde par la même occasion. Escortés par Hlodowig, ils atteignent le Sanctuaire in extremis avant que les Damnés ne les massacrent, sauvés par un groupe aux même don : Enoch, Ariès, Marya, Hétiel et Soliane.

Au Sanctuaire, Liodane, le chef des lieux et frère de Gédrihal, le seigneur de Voldo, explique aux nouveaux venus qu’ils sont les élus d’une prophétie créer par la déesse pour aider le Fenhir. Ils sont donc son bras armé divin dans la guerre qui oppose le seigneur à la citadelle de Vicit. Lilium s’oppose à cette version et en paie le prix fort : elle est enfermée pendant 7 jours mais échappe à un instrument de torture sur la tête, le casque de clos, qui la tue à la moindre vibration d’engélion.
Vicit est une cité très ancienne et puissante par delà la mer qui demeure la seule a s’opposer au Fenhir. Elle est connue pour abriter des guerriers sanguinaires qui volent l’engélion et le détourne pour leur usage personnel, quitte à assécher la planète et la mener à l’extinction, ou a laisser des villages démunis se faire massacrer par les Damnés.

Durant son séjour au sanctuaire, Lilium se lie d’amitié avec Éophémia, mais surtout avec Enoch, qui s’avère être l’enfant de la prophétie le plus puissant du Sanctuaire. Ensemble ils essayent d’appréhender le pouvoir immense de Lilium, en vain.
Lilium, poussée par le colonel Hlodowig qui, avant de partir pour Vicit à la guerre lui fait une dernière recommandation pour qu’elle s’échappe vite, décide de s’enfuir avec Enoch et Éophémia. Un entraînement cruel tourne mal, un de leur ami est tué et, ivre de rage, Enoch manque de massacrer Arman, un instructeur. La sanction réservée à Enoch précipite leur décision. Durant leur fuite, ils perdent Éophémia. En effet, Cael, endoctriné, a surpris leur conversation de fuite et a tout rapporté à ses supérieurs, sans savoir qu’ils seraient capables de tuer l’un d’entre eux.

Enoch et Lilium s’enfuient dans la forêt en pleine nuit, ravagés de chagrin. Durant leur marche dans les bois, les Damnés les suivent, aux aguets, et parviennent à blesser Lilium. De justesse, les deux amis trouvent réfugient dans un village perdu et sont recueillis. Dans ce village, ils sauvent la vie d’une femme mourante, nommée Rose, puis reprennent leur route vers le port d’Oskal dans le but de trouver un bateau et d’aller à Vicit, comme Sirius l’a dit à Lilium.

Effectivement, Sirius et son frère Asbel se trouvent à Vicit, bien qu’ils ne soient pas originaires de là-bas. Ils sont recueillis par le roi et la reine, Tudal et Fidèle. Le peuple de Vicit paraît très dévot, bien loin des idées qui circulent sur leur compte, et cherche désespérément « l’Élu de la prophétie » celui qui libérera Génésis de l’emprise du Fenhir et de la malédiction. Sirius semble convaincu qu’il s’agit de Lilium, bien que son cadet, Asbel, prétende l’inverse. Les deux frères semblent détenir des vérités uniques, et l’un d’eux, Asbel, paraît brisé par un évènement mystérieux qui lui a laissé en plein milieu du torse une énorme cicatrice. Quoiqu’il en soit, ils sont en parfaite opposition dans leur croyance : l’un se noie dans l’espoir et dans la religion tandis que le second prétend que la déesse les a abandonnés ou bien est morte.

Pendant ce temps, Morek, le général et homme de « confiance » du Fenhir, torture Cael et part à la poursuite de Lilium et d’Enoch, qui, après moult péripéties avec les Damnés en forêt, arrivent à Oskal. Morek et ses hommes découvrent le village où les deux fuyards ont fait halte et menacent de tout ravager. Mais, la femme sauvée par Enoch et Lilium, une dénommée Rose de Gardevoie, l’en empêche et révèle qu’elle est la soeur de la reine Célyne, souveraine de la grande cité d’Amundaria, fraîchement rallié aux Fenhir après une guerre acharnée. Morek les laisse donc en vie et part pour Oskal, tandis que Rose décide d’aller sans tarder prévenir sa soeur de ce qui se trame, persuadée qu’elle sautera sur l’occasion de se révolter contre le Fenhir.
Arrivés à Oskal donc, Lilium et Enoch parviennent après négociation à trouver un bateau qui accepte de les emmener à Vicit avec à son bord une mystérieuse femme prénommée Jay, à l’apparence complètement dissimulée. Les deux amis réalisent que le port d’Oskal est requestionné pour la guerre sur l’autre continent et que, la belle et unique entente qui régnait dans ce port avec les vicitiens est révolu : une chasse à l’homme est ouverte et une récompense est offerte pour tout vicitien dénoncé. Jay en est une, et elle ne doit sa survie que grâce à Lilium qui l’aide à s’échapper. Pendant que les deux femmes courent vers le bateau, Lilium réalise que tous les soldats sont à sa poursuite, menée par Morek. Une confrontation a lieu durant laquelle Morek essaye de convaincre Cael, brisé et borgne à cause de la torture, d’utiliser son don d’engélion pour l’aider à capturer Lilium.
Rongé par les remords pour Éophémia, il refuse et l’aide à s’enfuir. Alors qu’on le pense mort, Enoch parvient à le transporter de justesse sur le bateau qui s’enfuit en pleine mer.

Sur Hallegarde, Le Fenhir apprend que Lilium s’est échappée. Il ordonne à ses hommes de capturer sa famille mais font chou blanc, Kira et Jana ont disparu. Le Fenhir ne réagit pas a cette nouvelle dramatique, trop perturbé et dévasté par un souvenir : une mèche de cheveux, qui semble être la raison à sa folie : « aujourd’hui, cela fait 980 ans qu’il vit sans elle. Aujourd’hui, cela fait 980 ans qu’il a perdu la raison ». Et pour la première fois depuis le début du livre, on le voit humain, anéanti, et pleurer à chaude larme contre cette mystérieuse mèche de cheveux.

Sur le bateau, Lilium découvre l’existence de la prophétie de l’élu, racontée par Enoch et Jay, mais ne croit pas l’être, bien que ses amis soient persuadés du contraire. Après une querelle meurtrière sous fond d’impayée, Jay est forcée de révéler qu’elle est Tanwen, la fille du roi Tudal et héritière de Vicit, ses iris dorées parlant pour elle. Les malfrats qui les ont attaqués acceptent de les escorter jusqu’à vicit en espérant toucher une grosse somme d’argent en récompense. Le bateau vogue donc sur les courants d’air chaud créer par les Galanés, et vole littéralement au-dessus de l’eau.

Lilium fait un « cauchemar » ou elle voit une jeune femme aux longs cheveux noirs mourir dans ses bras après lui avoir dit « ne pas avoir peur, ne pas hésiter devant l’autel des morts ». Quand elle s’éveille et qu’elle raconte ce songe, Enoch lui dit que l’autel des morts se trouve sur le domaine de la reine Erèbe, demi-déesse de la mort et souveraine d’Amarii-Sabba, domaine des morts.
Le livre se termine sur Kira et Jana, escortées par ces fameux morts et servants de la reine Erèbe. Ils guident les deux femmes dans un lieu sûr, hors d’atteinte du Fenhir. Fait invraisemblable : quand les Servants d’Erèbe marchent parmi les Damnés, ces derniers ne les attaquent pas et gémissent ou semblent les supplier. Leurs curieux sauveurs font traverser un portail aux deux femmes. Durant ce moment, Kira fait un malaise et revis un évènement de son passé, très flou : elle sent que « quelqu’un », un garçon pour qui elle éprouve un attachement puissant la sauve de « quelque chose ». Submergée d’émotion, elle s’évanouit.
Quand elle s’éveille, la voix de la reine Erèbe l’accueille. Et fait incroyable : elle l’a déjà entendu et la reconnaît tout de suite.